乳腺外科外来で行います。乳腺組織診（針生検）では、細胞診に使用するより太い針を病変部に刺し、組織の一部を取り出します。
針が太いので基本、局所麻酔を行います。マンモグラフィ写真を確認し、超音波で確認しながら検査を行います。
検査時間は準備も含めて10分程度です。穿刺吸引細胞診に比較すると身体的負担はやや大きいのですが、通常、入院の必要はありません（日本乳癌学会：患者さんのための乳癌診療ガイドラインより）